Salut Crazy 
Pas facile de te répondre sans avoir plus d'info. Je vais essayer de t'apporter la réponse la plus pertinence, dans la limite de mes connaissances dans le domaine.
(En partant du principe que tu ne connais pas du tout la 3D)
Il y a, en particulier, un paramètre important à prendre en compte : Le type de modification à faire. En effet, des modifications qui paraissent pas vraiment compliquées peuvent s'avérer problématiques sans une bonne connaissance du logiciel utilisé.
Il faudrait savoir aussi si tu as l'envie de continuer ensuite dans la 3D, ou si c'est juste un besoin ponctuel. Il faut être conscient qu'il faut avoir du temps devant soi pour se lancer là dedans. C'est un domaine très vaste qui demande de l'apprentissage, et pas mal d'heures de pratique pour commencer à bosser réellement.
Ensuite, comme cela à été dit plus haut, si tu as l'intention d'en faire assez régulièrement, Fusion 360 est un logiciel gratuit très puissant, et pas si compliqué que ça a apprendre ... La preuve : Je m'y suis mis, même avec mes difficultés toujours présentes. Donc n'importe qui de normalement constitué peut y arriver .
Il y a aussi sketchup qui est gratuit et assez facile à prendre en main. Personnement, je trouve Fusion un peut plus compliqué à en comprendre la philosophie et à prendre en main, mais beaucoip plus facile d'utilisation ensuite.
Si tu n'as pas l'intention de continuer dans la 3D, et pour parler franchement, je te conseille de demander à quelqu'un sur le forum de te faire tes modifs sur le fichier STL. Y'en a certains qui ont montré leur compétence dans le domaine et n'en auront certainement que pour très peu de temps. A moins bien sûr que tu tiennes absolument à le faire toi même pour une raison quelconque.
Je vais me répéter, mais quelques soit le logiciel utilisé, il faudra passer par la case apprentissage.
Et tout dépendra aussi des modifications à faire. Peut être qu'elles seront très rapides à faire sans pour autant maitriser un logiciel de manière avancée ... ou pas
Mon point de vue, niveau uniquement logiciel :
Facile à prendre en main : Sketchup, mais demandera du temps d'apprentissage pour aller plus loin que faire des choses simples.
Fusion 360 : Il faudra regarder quelques vidéos pour bien comprendre le principe, et ensuite on peut très vite faire énormément de choses très facilement.
Je ne connais pas les autres logiciels
Mais bon pas moyen de changer de carte et ma 1080 s'annonce juste, en plus même si la promo est top, je pense qu'on peut espérer la retrouver plus tard ou en trouver d'occase à bon prix dans quelques mois
)
